上了皇位，随后赐死了前太子扶苏和大将军蒙恬。而上郡军团的三十万大军，改由蒙恬副手、名将王翦的孙子王离接手。在秦末战争的烽烟之中，刘邦、项羽先后率领关东群豪进攻关中，秦二世命令王离回援，与章邯等人率军攻打赵国，把赵歇和张耳围困在钜鹿城中。不久，楚国上将军项羽率领楚军前往援救巨鹿，攻打秦军，俘虏王离，王离的军队投降诸侯军。随着王离被俘，其所率领的大秦长城军团投降诸侯军后，留守上郡的长城军团余部也消失在历史长河之中。按照推算，王离率领南下的长城兵团人数应该在八到十万，那么留守的兵团士卒数量应该是十五到二十万，即使是数量减半，数量应该也是在十万左右，那么在秦末战争中，这部分主力军去了哪里是否真的像很多人说的那样“下落不明”呢

    有人传言，当年胡亥的昭书到达九原之前，事先得到消息的蒙恬和王离已经将长城军团中的蒙家子弟藏匿了部分人。随着王离大军兵败被俘后，长城军团中的王氏子弟意识到大秦已经到了日薄西山的地步，于是联合已经隐藏下来的蒙氏子弟，率领长城军团留守的数万大军及军属在大秦帝国覆灭之际，悄然的隐藏起来了。于是，名震天下的大秦长城军团便悄然消失在了历史长河之中。数百年来，忠于大秦始皇帝和公子扶苏的老秦人一直都在寻找这一支大秦历史上最强悍的军团，希望可以找到蒙王两氏统领的大军，重筑大秦雄风。经过数百年的细心寻找，种种线索都指向九原西边数百里处的乌梁素海，不过，线索也最终在此处中断了。得到线索的老秦人数次前往乌梁素海都没有能够寻找到任何消息，然后，这张记录线索的羊皮纸几经辗转最终落到了山贼手中，现在这张神秘图纸又被皇甫超博无意中获得。大秦长城军团的所有线索都记录在副本地图之上，玩家可以前往乌梁素海，凭借副本地图留下的线索，找到长城军团的位置，找到后，玩家有一定机率获得长城军团的效忠。