。与此同时还派员分赴苏州、无锡、镇江各处查访。

    6月12日下午，日领事馆一等秘书须磨、日本使馆参赞有野奉命来到国民政府外交部，“以藏本副领事行踪尚无着落，要求严饬彻查”。

    自藏本英明失踪后，南京宪兵司令部警务处、警察厅督察处接连几天组织探查。查访范围由市区扩展到城郊的京芜道路及沿江管辖区域。南京城里城外，行迹可疑者、面貌奇异者、似有精神病状态者都成了重点探查对象。重赏告示布满了全城要道，但直到6月12日晚仍无藏本英明线索。

    6月13日上午9时，军警当局接到明孝陵茶馆举报的有关线索，当即派人依此线索向明孝陵后山寻觅。上午11时左右，在明孝陵后山，发现了神情沮丧、蓬头垢面、身着西装的藏本英明。经查问姓名，核对照片确认是藏本英明无疑。

    警方当局派人请其下山登车入城，藏本英明坚辞不允。直到下午两点终于首肯，由警厅人员将他径直带至南京警察厅。藏本英明对于出走原因一再表示：“我不愿说，回领事馆后，也不愿发表。”但他强调：“我一身存亡与贵国均无关系，我今已回，贵国无负于我。”当美联社记者、路透社记者向藏本英明采访新闻谈话时，他言语清楚，记忆良好。

    6月13日下午，国民政府外交部通知日总领事馆须磨来部接洽转送藏本英明事宜。外交部次长唐有壬亲自出面接待。曾经登门兴师问罪的须磨一脸的尴尬。藏本英明的寻获使他怎么也高兴不起来，倒是藏本英明见到这位上司，涕泪横流，抽泣不止。之后，须磨领走了藏本英明。

    6月14日，日领事馆派须磨等人进见汪精卫时称：“过去疑云已一扫而空。两国邦交益见好转。”并掩饰说：“藏本副领事8日晚之出走，系一时神经衰弱，毫无其他原因。”第二天，日本驻南京领事馆派专人“陪同”藏本英明赴上海福民医院“疗养”。

    其间不准他接触任何宾客和来访记者。藏本英明及其眷属，在不久后由日警“护送”回国。搅得南京鸡犬不宁的藏本英明失踪事件，随着藏本英明的押解回国，销声匿迹。

    藏本英明失踪案，日本政府声嘶力竭的威胁引起南京全城的骚动，中国政府、外交部与警察在责任未明的情形下，便诚惶诚恐地四处寻找。可叶木花案，日本根本不把中国的态度当回事，年轻的叶木花的生命显得那么无足轻重、微不足道。当时一家刊物只能默默写下：“哀哉，叶木花！我们能说些什么呢？”